Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC9A3P48764 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A3P48764 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms