Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL28P46779 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL28P46779 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL28P46779 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL28P46779 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL28P46779 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL28P46779 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL28P46779 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL28P46779 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL28P46779 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL28P46779 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL28P46779 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL28P46779 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL28P46779 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL28P46779 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL28P46779 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL28P46779 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL28P46779 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL28P46779 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL28P46779 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL28P46779 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL28P46779 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL28P46779 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL28P46779 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL28P46779 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL28P46779 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL28P46779 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL28P46779 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL28P46779 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL28P46779 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL28P46779 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL28P46779 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL28P46779 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL28P46779 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL28P46779 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL28P46779 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL28P46779 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL28P46779 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL28P46779 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL28P46779 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms