Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSPAN7P41732 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN7P41732 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN7P41732 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms