Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL1P40616 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL1P40616 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL1P40616 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL1P40616 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARL1P40616 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL1P40616 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL1P40616 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL1P40616 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARL1P40616 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARL1P40616 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL1P40616 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL1P40616 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL1P40616 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL1P40616 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL1P40616 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL1P40616 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL1P40616 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL1P40616 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARL1P40616 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL1P40616 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL1P40616 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL1P40616 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARL1P40616 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARL1P40616 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL1P40616 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL1P40616 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL1P40616 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL1P40616 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARL1P40616 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARL1P40616 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARL1P40616 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL1P40616 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL1P40616 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARL1P40616 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL1P40616 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL1P40616 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL1P40616 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL1P40616 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL1P40616 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL1P40616 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL1P40616 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARL1P40616 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL1P40616 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL1P40616 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL1P40616 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL1P40616 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARL1P40616 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL1P40616 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL1P40616 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL1P40616 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL1P40616 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL1P40616 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL1P40616 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARL1P40616 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL1P40616 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL1P40616 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL1P40616 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL1P40616 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL1P40616 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL1P40616 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARL1P40616 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL1P40616 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL1P40616 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL1P40616 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL1P40616 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARL1P40616 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms