Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SERPINF1P36955 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SERPINF1P36955 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms