Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT2P35908 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT2P35908 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT2P35908 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT2P35908 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT2P35908 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT2P35908 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT2P35908 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT2P35908 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT2P35908 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT2P35908 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT2P35908 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT2P35908 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT2P35908 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT2P35908 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT2P35908 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT2P35908 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT2P35908 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT2P35908 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT2P35908 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT2P35908 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT2P35908 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT2P35908 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT2P35908 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT2P35908 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT2P35908 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT2P35908 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT2P35908 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT2P35908 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT2P35908 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT2P35908 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT2P35908 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT2P35908 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT2P35908 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT2P35908 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT2P35908 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT2P35908 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT2P35908 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT2P35908 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT2P35908 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT2P35908 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT2P35908 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT2P35908 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT2P35908 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT2P35908 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT2P35908 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT2P35908 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT2P35908 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT2P35908 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT2P35908 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT2P35908 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT2P35908 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT2P35908 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT2P35908 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT2P35908 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT2P35908 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT2P35908 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT2P35908 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KRT2P35908 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT2P35908 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT2P35908 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT2P35908 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT2P35908 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT2P35908 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT2P35908 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT2P35908 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT2P35908 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT2P35908 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT2P35908 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT2P35908 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT2P35908 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT2P35908 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT2P35908 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT2P35908 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT2P35908 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT2P35908 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT2P35908 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT2P35908 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT2P35908 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT2P35908 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT2P35908 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT2P35908 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT2P35908 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT2P35908 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT2P35908 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT2P35908 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT2P35908 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT2P35908 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT2P35908 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT2P35908 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT2P35908 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms