Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A4P31645 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A4P31645 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A4P31645 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms