Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD1CP29017 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD1CP29017 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD1CP29017 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD1CP29017 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD1CP29017 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD1CP29017 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD1CP29017 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CD1CP29017 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD1CP29017 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD1CP29017 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD1CP29017 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD1CP29017 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD1CP29017 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD1CP29017 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD1CP29017 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD1CP29017 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD1CP29017 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD1CP29017 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD1CP29017 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD1CP29017 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD1CP29017 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD1CP29017 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD1CP29017 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD1CP29017 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD1CP29017 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD1CP29017 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD1CP29017 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD1CP29017 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD1CP29017 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD1CP29017 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD1CP29017 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CD1CP29017 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD1CP29017 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD1CP29017 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD1CP29017 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CD1CP29017 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD1CP29017 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD1CP29017 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD1CP29017 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD1CP29017 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD1CP29017 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD1CP29017 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD1CP29017 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD1CP29017 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD1CP29017 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD1CP29017 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD1CP29017 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD1CP29017 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD1CP29017 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD1CP29017 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD1CP29017 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD1CP29017 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD1CP29017 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD1CP29017 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD1CP29017 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD1CP29017 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD1CP29017 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD1CP29017 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms