Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM3P25205 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM3P25205 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM3P25205 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM3P25205 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM3P25205 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM3P25205 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM3P25205 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM3P25205 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM3P25205 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM3P25205 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM3P25205 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM3P25205 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM3P25205 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM3P25205 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM3P25205 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM3P25205 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM3P25205 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM3P25205 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM3P25205 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM3P25205 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM3P25205 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM3P25205 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM3P25205 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM3P25205 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM3P25205 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM3P25205 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM3P25205 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM3P25205 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM3P25205 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM3P25205 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM3P25205 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM3P25205 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM3P25205 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM3P25205 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM3P25205 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM3P25205 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM3P25205 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM3P25205 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM3P25205 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCM3P25205 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM3P25205 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM3P25205 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM3P25205 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM3P25205 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM3P25205 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM3P25205 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM3P25205 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM3P25205 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM3P25205 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM3P25205 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM3P25205 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM3P25205 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM3P25205 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM3P25205 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM3P25205 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM3P25205 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM3P25205 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM3P25205 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM3P25205 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM3P25205 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM3P25205 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM3P25205 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM3P25205 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM3P25205 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM3P25205 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM3P25205 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM3P25205 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM3P25205 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM3P25205 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM3P25205 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM3P25205 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3P25205 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3P25205 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3P25205 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3P25205 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3P25205 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3P25205 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3P25205 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM3P25205 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3P25205 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3P25205 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3P25205 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM3P25205 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3P25205 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3P25205 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3P25205 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3P25205 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3P25205 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3P25205 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM3P25205 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms