Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRBP23467 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRBP23467 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRBP23467 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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