Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BCL3P20749 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BCL3P20749 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BCL3P20749 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BCL3P20749 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BCL3P20749 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BCL3P20749 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BCL3P20749 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BCL3P20749 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BCL3P20749 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BCL3P20749 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BCL3P20749 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BCL3P20749 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BCL3P20749 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCL3P20749 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCL3P20749 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCL3P20749 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BCL3P20749 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCL3P20749 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCL3P20749 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCL3P20749 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BCL3P20749 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BCL3P20749 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BCL3P20749 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
BCL3P20749 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCL3P20749 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCL3P20749 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BCL3P20749 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCL3P20749 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BCL3P20749 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BCL3P20749 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCL3P20749 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCL3P20749 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCL3P20749 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCL3P20749 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCL3P20749 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BCL3P20749 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BCL3P20749 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCL3P20749 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BCL3P20749 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCL3P20749 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCL3P20749 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCL3P20749 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCL3P20749 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCL3P20749 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCL3P20749 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BCL3P20749 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BCL3P20749 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms