Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRHP20396 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRHP20396 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRHP20396 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRHP20396 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRHP20396 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRHP20396 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRHP20396 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRHP20396 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRHP20396 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRHP20396 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRHP20396 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
TRHP20396 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRHP20396 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRHP20396 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
TRHP20396 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRHP20396 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRHP20396 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRHP20396 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRHP20396 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TRHP20396 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
TRHP20396 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TRHP20396 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
TRHP20396 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRHP20396 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRHP20396 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRHP20396 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
TRHP20396 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRHP20396 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRHP20396 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRHP20396 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRHP20396 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRHP20396 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRHP20396 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRHP20396 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRHP20396 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRHP20396 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRHP20396 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRHP20396 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRHP20396 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRHP20396 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRHP20396 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRHP20396 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRHP20396 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRHP20396 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRHP20396 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRHP20396 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRHP20396 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRHP20396 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TRHP20396 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRHP20396 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRHP20396 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
TRHP20396 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRHP20396 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRHP20396 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRHP20396 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRHP20396 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRHP20396 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRHP20396 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRHP20396 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TRHP20396 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
TRHP20396 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
TRHP20396 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
TRHP20396 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
TRHP20396 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRHP20396 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRHP20396 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRHP20396 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRHP20396 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
TRHP20396 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRHP20396 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TRHP20396 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRHP20396 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRHP20396 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
TRHP20396 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TRHP20396 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TRHP20396 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
TRHP20396 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
TRHP20396 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRHP20396 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRHP20396 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
TRHP20396 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRHP20396 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TRHP20396 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TRHP20396 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRHP20396 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRHP20396 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRHP20396 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TRHP20396 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
TRHP20396 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRHP20396 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRHP20396 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
TRHP20396 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRHP20396 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRHP20396 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRHP20396 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TRHP20396 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRHP20396 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRHP20396 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TRHP20396 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms