Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2CP19387 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2CP19387 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2CP19387 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms