Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD58P19256 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD58P19256 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD58P19256 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD58P19256 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD58P19256 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CD58P19256 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD58P19256 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CD58P19256 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD58P19256 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD58P19256 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD58P19256 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD58P19256 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD58P19256 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD58P19256 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CD58P19256 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD58P19256 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD58P19256 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD58P19256 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD58P19256 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD58P19256 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD58P19256 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD58P19256 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD58P19256 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD58P19256 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD58P19256 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD58P19256 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD58P19256 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD58P19256 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD58P19256 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD58P19256 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD58P19256 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD58P19256 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD58P19256 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD58P19256 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CD58P19256 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD58P19256 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD58P19256 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD58P19256 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD58P19256 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD58P19256 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD58P19256 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CD58P19256 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD58P19256 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CD58P19256 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD58P19256 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD58P19256 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD58P19256 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD58P19256 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD58P19256 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD58P19256 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD58P19256 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD58P19256 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CD58P19256 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD58P19256 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD58P19256 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD58P19256 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD58P19256 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD58P19256 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD58P19256 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CD58P19256 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD58P19256 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD58P19256 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD58P19256 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD58P19256 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD58P19256 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD58P19256 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD58P19256 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD58P19256 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD58P19256 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
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