Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATF3P18847 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATF3P18847 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATF3P18847 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATF3P18847 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATF3P18847 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATF3P18847 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF3P18847 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF3P18847 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF3P18847 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF3P18847 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF3P18847 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF3P18847 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF3P18847 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF3P18847 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATF3P18847 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATF3P18847 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ATF3P18847 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ATF3P18847 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ATF3P18847 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF3P18847 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF3P18847 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF3P18847 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF3P18847 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF3P18847 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATF3P18847 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATF3P18847 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATF3P18847 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATF3P18847 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ATF3P18847 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATF3P18847 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATF3P18847 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATF3P18847 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ATF3P18847 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ATF3P18847 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATF3P18847 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF3P18847 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF3P18847 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF3P18847 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF3P18847 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF3P18847 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF3P18847 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF3P18847 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF3P18847 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATF3P18847 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATF3P18847 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATF3P18847 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATF3P18847 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATF3P18847 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATF3P18847 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATF3P18847 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATF3P18847 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATF3P18847 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF3P18847 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF3P18847 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF3P18847 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF3P18847 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF3P18847 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF3P18847 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATF3P18847 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF3P18847 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF3P18847 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF3P18847 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF3P18847 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF3P18847 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF3P18847 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF3P18847 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF3P18847 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF3P18847 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF3P18847 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF3P18847 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATF3P18847 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF3P18847 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF3P18847 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF3P18847 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF3P18847 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF3P18847 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF3P18847 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF3P18847 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF3P18847 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATF3P18847 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATF3P18847 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATF3P18847 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF3P18847 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF3P18847 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF3P18847 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF3P18847 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF3P18847 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF3P18847 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF3P18847 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATF3P18847 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATF3P18847 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATF3P18847 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATF3P18847 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF3P18847 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF3P18847 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF3P18847 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF3P18847 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF3P18847 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF3P18847 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms