Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARGP13631 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARGP13631 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARGP13631 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARGP13631 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARGP13631 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RARGP13631 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARGP13631 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARGP13631 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARGP13631 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARGP13631 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARGP13631 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARGP13631 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARGP13631 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARGP13631 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARGP13631 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARGP13631 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARGP13631 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARGP13631 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RARGP13631 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RARGP13631 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARGP13631 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARGP13631 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARGP13631 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARGP13631 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARGP13631 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARGP13631 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARGP13631 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARGP13631 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARGP13631 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARGP13631 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARGP13631 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARGP13631 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARGP13631 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARGP13631 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARGP13631 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARGP13631 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARGP13631 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARGP13631 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARGP13631 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARGP13631 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARGP13631 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARGP13631 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RARGP13631 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RARGP13631 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARGP13631 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARGP13631 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARGP13631 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARGP13631 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARGP13631 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARGP13631 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARGP13631 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARGP13631 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARGP13631 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARGP13631 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARGP13631 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARGP13631 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARGP13631 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARGP13631 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARGP13631 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARGP13631 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARGP13631 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARGP13631 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RARGP13631 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARGP13631 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARGP13631 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARGP13631 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARGP13631 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARGP13631 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARGP13631 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARGP13631 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARGP13631 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARGP13631 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARGP13631 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARGP13631 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARGP13631 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RARGP13631 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARGP13631 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARGP13631 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARGP13631 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARGP13631 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARGP13631 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RARGP13631 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARGP13631 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARGP13631 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARGP13631 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARGP13631 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARGP13631 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARGP13631 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms