Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP4P12644 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP4P12644 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BMP4P12644 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP4P12644 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP4P12644 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP4P12644 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP4P12644 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP4P12644 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP4P12644 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP4P12644 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP4P12644 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BMP4P12644 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP4P12644 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP4P12644 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP4P12644 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP4P12644 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP4P12644 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BMP4P12644 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BMP4P12644 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP4P12644 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP4P12644 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP4P12644 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP4P12644 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP4P12644 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP4P12644 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BMP4P12644 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BMP4P12644 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP4P12644 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP4P12644 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP4P12644 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP4P12644 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP4P12644 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP4P12644 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP4P12644 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BMP4P12644 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BMP4P12644 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP4P12644 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP4P12644 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP4P12644 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP4P12644 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BMP4P12644 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BMP4P12644 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP4P12644 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP4P12644 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BMP4P12644 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP4P12644 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP4P12644 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP4P12644 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP4P12644 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP4P12644 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP4P12644 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP4P12644 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BMP4P12644 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BMP4P12644 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP4P12644 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP4P12644 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP4P12644 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP4P12644 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP4P12644 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP4P12644 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP4P12644 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BMP4P12644 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP4P12644 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP4P12644 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP4P12644 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP4P12644 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP4P12644 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP4P12644 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BMP4P12644 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms