Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPREB1P12018 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms