Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PABPC1P11940 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC1P11940 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PABPC1P11940 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms