Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ODC1P11926 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ODC1P11926 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ODC1P11926 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODC1P11926 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODC1P11926 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODC1P11926 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODC1P11926 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODC1P11926 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODC1P11926 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODC1P11926 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODC1P11926 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ODC1P11926 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODC1P11926 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODC1P11926 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODC1P11926 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODC1P11926 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODC1P11926 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODC1P11926 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODC1P11926 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODC1P11926 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODC1P11926 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODC1P11926 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODC1P11926 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODC1P11926 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODC1P11926 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODC1P11926 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODC1P11926 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODC1P11926 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ODC1P11926 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODC1P11926 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODC1P11926 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODC1P11926 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODC1P11926 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODC1P11926 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODC1P11926 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODC1P11926 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODC1P11926 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODC1P11926 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODC1P11926 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODC1P11926 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODC1P11926 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODC1P11926 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ODC1P11926 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ODC1P11926 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODC1P11926 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODC1P11926 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODC1P11926 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODC1P11926 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODC1P11926 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODC1P11926 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ODC1P11926 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODC1P11926 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODC1P11926 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODC1P11926 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODC1P11926 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODC1P11926 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODC1P11926 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODC1P11926 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODC1P11926 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODC1P11926 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODC1P11926 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODC1P11926 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODC1P11926 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODC1P11926 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ODC1P11926 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ODC1P11926 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODC1P11926 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODC1P11926 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODC1P11926 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODC1P11926 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODC1P11926 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ODC1P11926 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ODC1P11926 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODC1P11926 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODC1P11926 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODC1P11926 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODC1P11926 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms