Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD1P11586 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD1P11586 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFD1P11586 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms