Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLI4P10075 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GLI4P10075 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GLI4P10075 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GLI4P10075 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GLI4P10075 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GLI4P10075 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GLI4P10075 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GLI4P10075 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GLI4P10075 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GLI4P10075 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GLI4P10075 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GLI4P10075 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GLI4P10075 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GLI4P10075 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GLI4P10075 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GLI4P10075 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GLI4P10075 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GLI4P10075 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GLI4P10075 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GLI4P10075 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GLI4P10075 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GLI4P10075 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GLI4P10075 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GLI4P10075 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GLI4P10075 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GLI4P10075 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GLI4P10075 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI4P10075 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI4P10075 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI4P10075 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI4P10075 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI4P10075 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI4P10075 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GLI4P10075 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI4P10075 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI4P10075 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI4P10075 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI4P10075 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI4P10075 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI4P10075 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GLI4P10075 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI4P10075 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI4P10075 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI4P10075 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI4P10075 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI4P10075 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI4P10075 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI4P10075 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GLI4P10075 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GLI4P10075 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI4P10075 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI4P10075 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI4P10075 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI4P10075 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI4P10075 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI4P10075 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI4P10075 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI4P10075 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GLI4P10075 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI4P10075 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI4P10075 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI4P10075 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI4P10075 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GLI4P10075 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GLI4P10075 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GLI4P10075 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GLI4P10075 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GLI4P10075 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLI4P10075 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI4P10075 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI4P10075 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLI4P10075 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI4P10075 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI4P10075 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GLI4P10075 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI4P10075 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLI4P10075 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms