Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
GLI2P10070 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GLI2P10070 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
GLI2P10070 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
GLI2P10070 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
GLI2P10070 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
GLI2P10070 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
GLI2P10070 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
GLI2P10070 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GLI2P10070 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
GLI2P10070 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GLI2P10070 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GLI2P10070 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GLI2P10070 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
GLI2P10070 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
GLI2P10070 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GLI2P10070 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GLI2P10070 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GLI2P10070 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
GLI2P10070 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
GLI2P10070 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
GLI2P10070 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
GLI2P10070 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
GLI2P10070 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC37.45■■■■□ 3.59
GLI2P10070 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GLI2P10070 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
GLI2P10070 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
GLI2P10070 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
GLI2P10070 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GLI2P10070 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GLI2P10070 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
GLI2P10070 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GLI2P10070 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GLI2P10070 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GLI2P10070 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GLI2P10070 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GLI2P10070 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
GLI2P10070 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
GLI2P10070 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GLI2P10070 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GLI2P10070 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
GLI2P10070 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
GLI2P10070 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GLI2P10070 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GLI2P10070 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GLI2P10070 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
GLI2P10070 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.4■■■■□ 3.58
GLI2P10070 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
GLI2P10070 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
GLI2P10070 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GLI2P10070 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
GLI2P10070 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GLI2P10070 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GLI2P10070 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GLI2P10070 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
GLI2P10070 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GLI2P10070 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GLI2P10070 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
GLI2P10070 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GLI2P10070 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GLI2P10070 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
GLI2P10070 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GLI2P10070 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
GLI2P10070 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
GLI2P10070 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
GLI2P10070 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GLI2P10070 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GLI2P10070 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GLI2P10070 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GLI2P10070 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GLI2P10070 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
GLI2P10070 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GLI2P10070 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
GLI2P10070 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
GLI2P10070 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GLI2P10070 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GLI2P10070 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
GLI2P10070 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GLI2P10070 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GLI2P10070 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GLI2P10070 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GLI2P10070 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GLI2P10070 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GLI2P10070 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GLI2P10070 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GLI2P10070 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GLI2P10070 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GLI2P10070 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GLI2P10070 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GLI2P10070 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GLI2P10070 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9241.1 ms