Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VIL1P09327 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
VIL1P09327 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VIL1P09327 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VIL1P09327 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
VIL1P09327 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VIL1P09327 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VIL1P09327 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VIL1P09327 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VIL1P09327 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VIL1P09327 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VIL1P09327 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VIL1P09327 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VIL1P09327 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VIL1P09327 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VIL1P09327 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VIL1P09327 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VIL1P09327 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VIL1P09327 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
VIL1P09327 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VIL1P09327 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VIL1P09327 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VIL1P09327 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VIL1P09327 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VIL1P09327 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VIL1P09327 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VIL1P09327 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VIL1P09327 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VIL1P09327 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VIL1P09327 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VIL1P09327 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VIL1P09327 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VIL1P09327 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VIL1P09327 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VIL1P09327 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VIL1P09327 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VIL1P09327 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VIL1P09327 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VIL1P09327 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VIL1P09327 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VIL1P09327 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VIL1P09327 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VIL1P09327 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VIL1P09327 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VIL1P09327 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VIL1P09327 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VIL1P09327 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VIL1P09327 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VIL1P09327 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VIL1P09327 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VIL1P09327 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VIL1P09327 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VIL1P09327 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VIL1P09327 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VIL1P09327 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VIL1P09327 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VIL1P09327 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VIL1P09327 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
VIL1P09327 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VIL1P09327 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VIL1P09327 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VIL1P09327 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VIL1P09327 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VIL1P09327 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VIL1P09327 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
VIL1P09327 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VIL1P09327 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VIL1P09327 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VIL1P09327 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VIL1P09327 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VIL1P09327 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VIL1P09327 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VIL1P09327 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VIL1P09327 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VIL1P09327 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VIL1P09327 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VIL1P09327 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VIL1P09327 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VIL1P09327 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VIL1P09327 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VIL1P09327 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms