Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA5P08648 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA5P08648 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA5P08648 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA5P08648 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA5P08648 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA5P08648 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA5P08648 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA5P08648 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA5P08648 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA5P08648 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA5P08648 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA5P08648 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA5P08648 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITGA5P08648 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA5P08648 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA5P08648 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA5P08648 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA5P08648 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA5P08648 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGA5P08648 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGA5P08648 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA5P08648 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA5P08648 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITGA5P08648 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA5P08648 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITGA5P08648 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA5P08648 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms