Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP1B1P05026 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1B1P05026 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1B1P05026 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms