Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF2P04141 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF2P04141 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF2P04141 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF2P04141 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF2P04141 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF2P04141 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF2P04141 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF2P04141 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF2P04141 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF2P04141 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF2P04141 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF2P04141 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF2P04141 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF2P04141 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF2P04141 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF2P04141 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF2P04141 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF2P04141 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF2P04141 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF2P04141 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF2P04141 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF2P04141 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF2P04141 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF2P04141 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF2P04141 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF2P04141 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF2P04141 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF2P04141 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF2P04141 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF2P04141 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF2P04141 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF2P04141 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF2P04141 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF2P04141 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF2P04141 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF2P04141 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF2P04141 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF2P04141 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF2P04141 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF2P04141 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF2P04141 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF2P04141 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF2P04141 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF2P04141 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF2P04141 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF2P04141 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF2P04141 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF2P04141 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF2P04141 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF2P04141 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF2P04141 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF2P04141 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF2P04141 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF2P04141 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF2P04141 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF2P04141 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF2P04141 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF2P04141 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF2P04141 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF2P04141 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF2P04141 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF2P04141 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF2P04141 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF2P04141 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF2P04141 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF2P04141 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF2P04141 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF2P04141 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSF2P04141 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF2P04141 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF2P04141 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF2P04141 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF2P04141 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF2P04141 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF2P04141 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF2P04141 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF2P04141 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF2P04141 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF2P04141 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF2P04141 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms