Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED1O96006 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZBED1O96006 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZBED1O96006 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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