Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TOP3BO95985 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOP3BO95985 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOP3BO95985 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms