Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNDBP1O95273 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1O95273 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1O95273 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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