Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP19O94966 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP19O94966 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP19O94966 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP19O94966 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USP19O94966 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP19O94966 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP19O94966 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
USP19O94966 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP19O94966 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP19O94966 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
USP19O94966 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP19O94966 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP19O94966 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
USP19O94966 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP19O94966 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP19O94966 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
USP19O94966 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP19O94966 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP19O94966 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
USP19O94966 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP19O94966 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP19O94966 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP19O94966 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
USP19O94966 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
USP19O94966 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
USP19O94966 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP19O94966 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP19O94966 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP19O94966 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
USP19O94966 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
USP19O94966 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
USP19O94966 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP19O94966 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP19O94966 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP19O94966 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
USP19O94966 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USP19O94966 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP19O94966 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP19O94966 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
USP19O94966 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP19O94966 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
USP19O94966 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP19O94966 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP19O94966 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP19O94966 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP19O94966 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP19O94966 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP19O94966 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP19O94966 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP19O94966 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP19O94966 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP19O94966 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP19O94966 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP19O94966 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP19O94966 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP19O94966 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP19O94966 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP19O94966 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP19O94966 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP19O94966 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP19O94966 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP19O94966 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP19O94966 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP19O94966 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP19O94966 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP19O94966 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP19O94966 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP19O94966 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
USP19O94966 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP19O94966 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP19O94966 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP19O94966 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP19O94966 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP19O94966 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP19O94966 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP19O94966 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP19O94966 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP19O94966 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP19O94966 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP19O94966 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP19O94966 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP19O94966 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP19O94966 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
USP19O94966 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP19O94966 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP19O94966 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP19O94966 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP19O94966 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
USP19O94966 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP19O94966 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.7 ms