Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FARP2O94887 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FARP2O94887 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP2O94887 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP2O94887 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FARP2O94887 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FARP2O94887 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FARP2O94887 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FARP2O94887 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FARP2O94887 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FARP2O94887 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FARP2O94887 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FARP2O94887 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FARP2O94887 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FARP2O94887 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FARP2O94887 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FARP2O94887 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FARP2O94887 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FARP2O94887 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FARP2O94887 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FARP2O94887 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FARP2O94887 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FARP2O94887 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FARP2O94887 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FARP2O94887 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FARP2O94887 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FARP2O94887 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FARP2O94887 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FARP2O94887 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FARP2O94887 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FARP2O94887 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FARP2O94887 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP2O94887 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP2O94887 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP2O94887 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP2O94887 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP2O94887 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP2O94887 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP2O94887 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP2O94887 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FARP2O94887 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FARP2O94887 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FARP2O94887 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FARP2O94887 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FARP2O94887 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FARP2O94887 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FARP2O94887 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FARP2O94887 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FARP2O94887 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FARP2O94887 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FARP2O94887 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FARP2O94887 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FARP2O94887 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FARP2O94887 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FARP2O94887 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP2O94887 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP2O94887 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP2O94887 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP2O94887 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP2O94887 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FARP2O94887 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FARP2O94887 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FARP2O94887 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FARP2O94887 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FARP2O94887 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FARP2O94887 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FARP2O94887 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FARP2O94887 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FARP2O94887 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FARP2O94887 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FARP2O94887 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FARP2O94887 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FARP2O94887 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FARP2O94887 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FARP2O94887 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FARP2O94887 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FARP2O94887 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FARP2O94887 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FARP2O94887 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms