Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BBOX1O75936 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
BBOX1O75936 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BBOX1O75936 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms