Protein–RNA interactions for Protein: O75792

RNASEH2A, Ribonuclease H2 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH2AO75792 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNASEH2AO75792 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNASEH2AO75792 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNASEH2AO75792 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH2AO75792 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH2AO75792 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH2AO75792 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH2AO75792 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNASEH2AO75792 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH2AO75792 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNASEH2AO75792 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms