Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX1O43812 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX1O43812 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX1O43812 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX1O43812 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX1O43812 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUX1O43812 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUX1O43812 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUX1O43812 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DUX1O43812 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUX1O43812 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX1O43812 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX1O43812 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX1O43812 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX1O43812 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX1O43812 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX1O43812 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUX1O43812 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUX1O43812 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUX1O43812 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUX1O43812 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUX1O43812 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUX1O43812 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUX1O43812 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUX1O43812 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUX1O43812 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUX1O43812 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUX1O43812 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUX1O43812 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUX1O43812 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUX1O43812 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUX1O43812 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUX1O43812 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUX1O43812 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DUX1O43812 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUX1O43812 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUX1O43812 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUX1O43812 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DUX1O43812 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DUX1O43812 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DUX1O43812 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DUX1O43812 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUX1O43812 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUX1O43812 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUX1O43812 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DUX1O43812 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUX1O43812 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUX1O43812 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUX1O43812 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUX1O43812 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUX1O43812 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUX1O43812 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUX1O43812 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUX1O43812 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUX1O43812 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUX1O43812 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUX1O43812 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUX1O43812 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUX1O43812 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUX1O43812 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DUX1O43812 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUX1O43812 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DUX1O43812 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX1O43812 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX1O43812 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX1O43812 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX1O43812 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX1O43812 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX1O43812 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DUX1O43812 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX1O43812 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX1O43812 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX1O43812 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX1O43812 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX1O43812 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX1O43812 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DUX1O43812 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX1O43812 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX1O43812 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX1O43812 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX1O43812 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX1O43812 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX1O43812 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DUX1O43812 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUX1O43812 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUX1O43812 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUX1O43812 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUX1O43812 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DUX1O43812 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUX1O43812 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUX1O43812 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUX1O43812 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUX1O43812 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUX1O43812 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DUX1O43812 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUX1O43812 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DUX1O43812 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUX1O43812 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUX1O43812 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUX1O43812 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms