Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITM2AO43736 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITM2AO43736 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms