Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD6O43541 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMAD6O43541 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMAD6O43541 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms