Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPTLC1O15269 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTLC1O15269 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms