Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN7O15265 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN7O15265 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATXN7O15265 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN7O15265 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms