Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SURF4O15260 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SURF4O15260 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SURF4O15260 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SURF4O15260 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SURF4O15260 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SURF4O15260 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SURF4O15260 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SURF4O15260 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SURF4O15260 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SURF4O15260 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SURF4O15260 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SURF4O15260 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SURF4O15260 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SURF4O15260 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SURF4O15260 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SURF4O15260 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SURF4O15260 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SURF4O15260 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SURF4O15260 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SURF4O15260 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SURF4O15260 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SURF4O15260 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF4O15260 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF4O15260 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF4O15260 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF4O15260 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF4O15260 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF4O15260 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF4O15260 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SURF4O15260 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF4O15260 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF4O15260 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF4O15260 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF4O15260 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF4O15260 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF4O15260 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF4O15260 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF4O15260 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SURF4O15260 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF4O15260 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF4O15260 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF4O15260 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF4O15260 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF4O15260 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF4O15260 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF4O15260 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SURF4O15260 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SURF4O15260 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF4O15260 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF4O15260 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF4O15260 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF4O15260 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF4O15260 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF4O15260 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF4O15260 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SURF4O15260 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SURF4O15260 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SURF4O15260 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SURF4O15260 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SURF4O15260 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SURF4O15260 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SURF4O15260 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SURF4O15260 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SURF4O15260 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SURF4O15260 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SURF4O15260 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SURF4O15260 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SURF4O15260 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SURF4O15260 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SURF4O15260 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SURF4O15260 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SURF4O15260 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SURF4O15260 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SURF4O15260 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SURF4O15260 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SURF4O15260 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SURF4O15260 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SURF4O15260 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SURF4O15260 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SURF4O15260 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SURF4O15260 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SURF4O15260 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SURF4O15260 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SURF4O15260 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SURF4O15260 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SURF4O15260 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SURF4O15260 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SURF4O15260 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SURF4O15260 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SURF4O15260 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms