Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PFDN6O15212 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN6O15212 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN6O15212 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms