Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TOR1AO14656 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOR1AO14656 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms