Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3KRW8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3KRW8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3KRW8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3KRW8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3KRW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
J3KRW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
J3KRW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
J3KRW8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
J3KRW8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3KRW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3KRW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3KRW8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3KRW8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3KRW8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
J3KRW8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3KRW8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3KRW8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3KRW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3KRW8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3KRW8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3KRW8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
J3KRW8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3KRW8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
J3KRW8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KRW8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KRW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KRW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KRW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KRW8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
J3KRW8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
J3KRW8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
J3KRW8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
J3KRW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
J3KRW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3KRW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3KRW8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3KRW8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3KRW8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3KRW8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
J3KRW8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3KRW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3KRW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3KRW8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3KRW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3KRW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3KRW8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
J3KRW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
J3KRW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
J3KRW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
J3KRW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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