Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQF6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQF6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BQF6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQF6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQF6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQF6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQF6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQF6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQF6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQF6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQF6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BQF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQF6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQF6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQF6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQF6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H3BQF6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQF6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQF6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQF6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQF6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H3BQF6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQF6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQF6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQF6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQF6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQF6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H3BQF6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQF6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQF6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQF6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BQF6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQF6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQF6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQF6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQF6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQF6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQF6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BQF6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQF6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQF6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQF6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQF6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQF6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BQF6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQF6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQF6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQF6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQF6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQF6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BQF6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQF6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQF6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BQF6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQF6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQF6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQF6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQF6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQF6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQF6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BQF6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQF6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQF6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQF6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQF6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQF6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQF6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQF6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H3BQF6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H3BQF6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQF6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQF6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQF6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQF6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H3BQF6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQF6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQF6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQF6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQF6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQF6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQF6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQF6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H3BQF6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQF6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQF6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQF6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQF6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQF6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQF6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQF6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
H3BQF6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQF6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQF6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQF6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H3BQF6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms