Protein–RNA interactions for Protein: F5GYI3

UBAP1L, Ubiquitin-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1LF5GYI3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
UBAP1LF5GYI3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
UBAP1LF5GYI3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.8■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.78■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.77■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UBAP1LF5GYI3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
UBAP1LF5GYI3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
UBAP1LF5GYI3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms