Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IQCJ-SCHIP1C9J366 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IQCJ-SCHIP1C9J366 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IQCJ-SCHIP1C9J366 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms