Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARID3CA6NKF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ARID3CA6NKF2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
ARID3CA6NKF2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ARID3CA6NKF2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
ARID3CA6NKF2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms