Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
STRCP1A6NGW2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
STRCP1A6NGW2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
STRCP1A6NGW2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
STRCP1A6NGW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms