Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NCN8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NCN8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NCN8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NCN8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NCN8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A6NCN8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NCN8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NCN8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A6NCN8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NCN8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NCN8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NCN8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NCN8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NCN8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NCN8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NCN8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NCN8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A6NCN8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A6NCN8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NCN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NCN8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NCN8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NCN8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NCN8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NCN8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NCN8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NCN8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A6NCN8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NCN8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NCN8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NCN8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NCN8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A6NCN8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NCN8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NCN8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NCN8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NCN8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NCN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A6NCN8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NCN8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NCN8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NCN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A6NCN8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A6NCN8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A6NCN8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NCN8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NCN8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NCN8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A6NCN8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NCN8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A6NCN8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NCN8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NCN8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NCN8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NCN8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A6NCN8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NCN8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NCN8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NCN8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NCN8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NCN8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NCN8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NCN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A6NCN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NCN8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NCN8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A6NCN8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms