Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRD1A4D1F6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRD1A4D1F6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRD1A4D1F6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms